帕金森病（PD）是一種常見的老年神經(jīng)退行性疾病。近年來國內(nèi)外大樣本全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）等研究發(fā)現(xiàn)了系列與PD相關(guān)的單核苷酸變異（SNP），但基因組上的結(jié)構(gòu)變異、拷貝數(shù)變異和短串聯(lián)重復變異與PD的關(guān)系仍不明確。7月23日，首都醫(yī)科大學宣武醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)科王朝東教授和陳彪教授，聯(lián)合華大基因研究院張建國研究員和劉漢奎助理研究員，在國際著名期刊《npj Parkinson’s disease》（Nature子刊）在線發(fā)表了題為”High-depth whole-genome sequencing identifies structure variants, copy number variants and short tandem repeats associated with Parkinson’s disease”的研究論著。王朝東教授、劉漢奎研究員為共同第一作者，陳彪教授和張建國研究員為共同通訊作者。該研究受國家重點研發(fā)計劃項目(2021YFC2501200；2018YFC1312001)和國家自然科學基金面上項目（82371259; 82171412）資助。

該研究首次通過高深度全基因組測序，聯(lián)合長讀長、Sanger測序和定量PCR（qPCR）等技術(shù)確認了MUC19基因上1.6kb缺失變異、RXFP1基因上的12.4kb拷貝數(shù)變異和SLC2A13基因上的GGGAAA重復數(shù)目與帕金森病顯著相關(guān)。同時，發(fā)現(xiàn)SLC2A13和MUC19基因分別位于LRRK2基因的上下游，5拷貝的GGGAAA重復單元擴增和缺失型MUC19結(jié)構(gòu)變異顯著降低了LRRK2 G2385R（最常見的東亞人群帕金森病相關(guān)變異）的發(fā)病風險。這一發(fā)現(xiàn)首次為G2385R找到了遺傳修飾因素，也為其臨床上表現(xiàn)的相對低外顯率提供了解釋。此外，研究團隊還發(fā)現(xiàn)，人類染色體兩端5Mb的區(qū)間內(nèi)帕金森患者的拷貝數(shù)變異負荷顯著更高。而且隨著年齡的增長，健康對照的染色體末端CNV負荷也隨之升高，提示了染色體端粒變異、衰老和帕金森病的關(guān)系。